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第三届浮游动物图像扫描分析系统ZooSCAN全国用户培训会圆满落幕
访问数量:156发布时间:2019-08-07

为了回馈全国用户,也为了使ZooSCAN的新老客户能够更加熟练、准确的操作设备,青岛水德仪器有限公司分别于2019年7月23-24日,7月30-31日及8月5-6日在青岛黄海饭店、上海威斯汀大饭店以及广州海航威斯汀酒店举办了“第三届浮游动物图像扫描分析系统ZooSCAN全国用户培训会(青岛站、上海站、广州站)”。来自全国二十多家科研院所,专注研究浮游生物相关领域的七十余位专家、老师积极前来参加此次培训会。三场培训会均取得了圆满成功,并获得了参会老师的一致好评。

水德仪器为与会人员精心准备了详尽的会议资料

会议签到

会议开幕,由水德仪器总经理张国豪先生致欢迎辞,他表示了对各位与会专家们的热烈欢迎和由衷感谢,并简要的介绍了本次培训会举办的目的——即能够使每一位ZooSCAN的用户都能够真正利用好设备,为各位专家的科研之路提供微薄之力。

张国豪总经理为会议致欢迎辞 

培训会主要以PPT讲解和上机操作相结合的方式进行,以使每一位用户都能够独立使用ZooSCAN。此外,法国HYDROPTIC公司建立了一个全球浮游动物数据共享平台——EcoTaxa网站,该网站目前已经包含六千多万张图片,拥有上千个浮游动物数据库。利用该网站,ZooSCAN的用户可以更加方便、高效的完成浮游动物种类鉴定工作。对该部分功能的介绍也是此次培训会的重点及亮点。

培训内容主要由水德仪器的产品专员谭畅负责讲解,她专门负责法国HYDROPTIC公司ZooSCAN浮游动物图像扫描分析系统的技术及售后服务工作,对ZooSCAN的使用情况及技术非常了解。此次来参会的很多专家都是水德仪器及ZooSCAN的老用户,他们对ZooSCAN的作用、操作方法有一定的了解,但是也有许多新用户,他们刚刚接触到ZooSCAN这台设备。因此,此次培训会,谭畅主要将培训内容分为三个部分:(1)通过PPT的形式简要介绍仪器产生的背景、主要功能、优势所在及当前的应用进展;(2)通过实际上机操作的方式为大家介绍仪器的各个组件及其对应功能、软件安装方法、扫描操作与数据处理流程及后续的浮游动物鉴定网站——EcoTaxa的使用方法;(3)针对培训内容及以往的设备操作经验,与会专家可以自由开展讨论,并可以提出问题进行交流。

产品专员谭畅对ZooSCAN进行简要介绍 

(1)PPT讲解

在PPT讲解部分,谭畅首先向大家介绍了仪器产生的背景:由于浮游动物是海洋初级生产力向高营养级的传递者,是浮游食物网、物质循环及能量流动的关键组成部分。由于它在生态学中的关键位置,并且近年来对海洋的探索不断加深、加大,造成浮游动物数据海量增加。而当前对浮游动物的研究手段非常单一,主要还是依靠传统的人工镜检的方式,这样会造成工作量非常巨大,导致分析结果滞后。基于以上种种原因,法国巴黎大学、法国国家科学院Villefranche海洋研究所及法国HYDROPTIC公司联手打造了一款专门用于浮游动物研究的设备——ZooSCAN。

ZooSCAN的主要功能就是对浮游动物样品进行扫描、计数、形态测量、种类鉴定以及生物量估算。整个系统主要包括三大部分:ZooSCAN主机、处理软件Zooprocess及种类鉴定网站EcoTaxa。主机部分主要进行浮游动物样品扫描,将其形成数字化图像;软件Zooprocess以标准化的程序处理原始图片,对原始图片进行自动的提取并测量图片中不同个体的形态学参数,通过对形态学参数的提取与分析,可进一步获得样品的粒径组成、生物学体积等相关信息;此后,可以利用EcoTaxa网站已建立的浮游动物图像培训数据库,针对已扫描的样品图像进行浮游动物的自动识别,获得不同类群浮游动物的数量。

ZooSCAN主机图

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EcoTaxa网站主界面



EcoTaxa部分数据库展示

谭畅在PPT中还向与会专家们展示了一部分使用ZooSCAN仪器发表的文献,并展示了一些文献中所得到的不同种类的浮游动物体型参数与湿重、干重、碳/氮含量回归关系的实验结果。专家老师们对此部分非常感兴趣,并认真拍照记录。

相关文献结果展示

与会专家认真记录

(2)上机操作

通过PPT的方式给大家简要介绍过ZooSCAN之后,便开始了正式的上机操作过程。首先,谭畅带领大家先认识了ZooSCAN的硬件组成部分,包括主机的上盖、操作平台、样品池、样品框、拨样针、扫描组件、随机优盘及分样器等。

谭畅对仪器组成进行介绍

随后,谭畅带领大家一起安装了仪器的操作软件。很多与会专家自带了手提电脑,非常认真的跟着安装步骤一起安装。其中一些老师在安装软件的过程中遇到了问题,也都积极的寻求了协助并得到了解决。

专家们认真学习软件安装

讨论解决软件安装遇到的问题 

软件顺利安装完毕后,大家一起聚在仪器旁,近距离观察仪器的操作步骤。谭畅向大家展示了如何利用Zooprocess软件进行新项目的创建,并介绍、演示了填写样品元数据信息、扫描空白、扫描样品、转换&处理成小图及手动切割小图等完整的操作步骤。操作期间感兴趣的专家也亲自进行了操作,并认真查看了切割完成的浮游动物大图、小图及对应的数据处理结果。

 

上机操作学习

专家亲自动手操作

处理流程讲解

最后,谭畅给大家讲解了全球浮游动物数据共享平台——EcoTaxa网站的使用方法。包括如何在网站上搜索感兴趣的浮游动物图片及感兴趣的项目、浏览网站上已有的浮游动物数据库以及使用Zooprocess完成图片及数据处理后,如何在EcoTaxa网站上创建自己的项目并选择合适的数据库对自己的图片进行种类鉴定等一系列过程。对这一部分内容,各位专家老师尤其感兴趣,他们自己创建了EcoTaxa网站的账号并跟着讲解步骤不断的搜索网站中的项目进行浏览。

(3)自由讨论

会议进行到最后,与会专家们对ZooSCAN有了更加全面的认识。针对新老用户在仪器使用时产生的一些问题,或在培训过程中遇到的一些困惑,水德仪器的总经理张国豪先生及产品专员谭畅与专家们展开了热烈的讨论,并对一些问题进行了答疑。使用过ZooSCAN设备的专家们互相之间也进行了交流,并分享使用过程中的一些心得体会。另外,来自中国科学院南海海洋研究所的连老师也分享了使用ZooSCAN设备的一些经验,并对我们的仪器在浮游动物粒径谱研究方向中做出的贡献表示了肯定。

在海洋生态系统中,微型单细胞藻类是主要的初级生产者。植食动物及其他较高营养级的肉食动物大多以吞食的方式摄食。海洋生物的这一摄食特点决定了被捕食者的个体通常要比捕食者的个体小。因此,研究中可以按照粒径大小将生态系统中的生物进行分类,并假设能量沿着粒径增大的方向流动。通过粒径(size)这一标准,将各生物个体划分入某一特殊的粒径级别,达到简化生态系统食物网的目的,解决了通过其他标准无法解决的困难。另外,粒径也是生理学和生态学相关参数,这也支持了粒径作为划分因素和聚类标准的应用。对于海洋中的浮游动物来说,这一理论同样适用。而对于ZooSCAN来说,它所配备的软件Zooprocess能够自动为扫描的浮游动物测算出它们的面积、ESD值、生物体积等参数,大大减小了这一过程中的工作量。

会后交流

三个场次的培训会均取得了圆满的成功,其中离不开各位与会专家老师们的信任与支持。在此,预祝各位老师在ZooSCAN的帮助下能够获得更加丰硕的科研成果,也期待下一次与业内专家们的见面!

参会人员合影留念